Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms