Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms