Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cited4Q9WUL8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms