Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scn8aQ9WTU3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn8aQ9WTU3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms