Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt71Q9R0H5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt71Q9R0H5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms