Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nek3Q9R0A5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms