Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms