Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms