Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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