Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf3Q9QXK7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms