Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc5Q9QX29 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms