Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Dkk3Q9QUN9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms