Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Habp4Q9JKS5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms