Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msgn1Q9JK54 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms