Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra4Q9JJT2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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