Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efcc1Q9JJF6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efcc1Q9JJF6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms