Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clstn1Q9EPL2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms