Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde1Q9DBZ9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms