Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg8Q9DBM0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms