Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG6

Rpn2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpn2Q9DBG6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpn2Q9DBG6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms