Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rrp8Q9DB85 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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