Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc89Q9DA73 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms