Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf138rt1Q9D9M9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms