Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf225Q9D7D1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf225Q9D7D1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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