Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc94Q9D6J3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms