Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms