Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms