Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3404Q9D506 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3404Q9D506 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm3404Q9D506 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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