Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubgcp4Q9D4F8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms