Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx29Q9D3S3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms