Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms