Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms