Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem88Q9D0N8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms