Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms