Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mms19Q9D071 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Mms19Q9D071 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Mms19Q9D071 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Mms19Q9D071 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mms19Q9D071 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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