Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms