Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc8Q9CYA6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms