Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Exo5Q9CXP9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms