Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim8Q9CQQ0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms