Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl35Q9CQL6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl35Q9CQL6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl35Q9CQL6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Mrpl35Q9CQL6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl35Q9CQL6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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