Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdm1Q9CQK3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms