Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQC3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms