Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQ90 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQ90 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms