Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms