Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms