Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe41Q99PV5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms