Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2a1Q99PM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms