Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms