Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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