Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Sh3bp5lQ99LH9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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